编辑载体

我们实验室的载体主要是基于CRISPR/Cas9技术的基因组编辑载体，包含了多种不同的载体类型和应用场景。以下是一些常用的载体下载链接；

请注意，下载和使用这些载体需要遵守相关的法律法规和伦理规范。我们建议在使用前仔细阅读相关的实验手册和转让协议。

载体转让协议签字盖章后扫描电子版pdf文件【文件命名为：时间_单位_姓名_载体类型_MTA.pdf，如 20250608_华中农业大学_张三_Cas9_MTA.pdf】，然后通过【指定链接 】上传给我们，并附上贵单位详细地址和快递收件人信息，相关载体随后安排顺丰邮寄。

另外，本实验室也有用于棉花遗传转化的高效受体材料Jin668【参考CottonHub of T2T-Jin668 】，如需要请下载协议【Jin668_Seed_MTA.doc 】，同样签字扫描后上传pdf电子版【时间_单位_姓名_Jin668_MTA.pdf】。

注意：邮寄的载体均为大肠杆菌且抗性均为卡纳抗性。

编辑类型 载体名称 编辑序列 PAM位点 平均编辑效率 编辑特征 缺陷或局限性 备注 载体图（SnapGene格式） 载体构建实验手册 载体转让协议（签字盖章后扫描电子版上传）
Cas9 pRGEB32-GhU6.9-NPT2-Cas9 DNA NGG ≥90% 随机的小片段插入/缺失；基因失活 非NGG位点无法编辑；蛋白体积大，递送受限； pRGEB32-GhU6.9-NPT2-Cas9.dna Cas9_protocol.pdf Cas9_MTA
Cas12 Mb2Cas12a DNA TTTV >90% PAM下游13-26nt ，产生较长片段17-26bp的缺失 靶标选取存在特异性，网站预测评分很高的靶标编辑效率不一定高，建议多设计几个靶标 在TTV PAM也可以产生编辑，但效率较低 Mb2Cas12a.tar.gz Mb2Cas12a_protocol.pdf Mb2Cas12a_MTA
单碱基 GhABE8e DNA NGG ≥80% PAM上游第4–8位碱基处的A→G或T→C碱基的替换； 编辑窗口较宽，特异性受限； ABE8e_KanR.dna ABE8e_protocol.pdf ABE8e_MTA
单碱基 GhTBE DNA NGG >30% PAM上游第3-10位碱基处的T→G/A碱基的替换； 编辑窗口宽，且存在碱基的删除
单碱基 GhCBE-DMA3ABE4max DNA NGG >80% PAM 上游第4-15位可以进行C→T的碱基转换 编辑窗口宽，不适合单个位点的编辑 GhTad-CBE_KanR.dna GhTad-CBE_protocol.pdf GhTad-CBE_MTA
单碱基 GhCBE-GhevoCDA1 DNA NGG >80% C→T的碱基转换；编辑窗口很宽，PAM上游的C1-C14位点均可编辑，C1最高可达70.38%，C14最高可达67.47%； 编辑窗口宽，不适合单个位点的编辑
双碱基 GhTadADE（ABE+CBE） DNA NGG ≥30% PAM上游第4-8位碱基处的A→G和C→T同时碱基的替换； 存在靶标偏好性，有的靶标A编辑高，有的靶标C编辑高
Cas13 Cas13A,B,C,D,X,Y RNA 无 20%-80% RNA降解；类似 RNAi 效果 编辑窗口宽，部分蛋白有单个碱基偏好性的需求 GhCas13d_KanR.dna GhCas13d_protocol.pdf GhCas13d_MTA
表观编辑 TDE/TME RNA 无 20%-80% m6A特定位点的特异性去甲基化/甲基化 编辑窗口宽
PE EPEmax DNA NGG <17.5% 根据RTT可以实现敲入 敲入片段不完整，替换无效率
多基因编辑 激活（GhdCas9-TV） DNA NGG 与基因本体表达有关 原位转录激活，功能效果类似超表达；最多可同时激活6个基因； 非NGG位点无法编辑，受到基因起始表达的影响 GhdCas9-TV.dna GhdCas9-TV_protocol.pdf GhdCas9-TV_MTA
多基因编辑 pRGEB32-GhU6.9-NPT2-Cas9 DNA NGG >70% 随机的小片段插入/缺失；基因失活 非NGG位点无法编辑；蛋白体积大，递送受限； 已构建8个基因的敲除载体，8个基因都有编辑，最低编辑效率在70%左右 pRGEB32-GhU6.9-NPT2-Cas9.dna Cas9_protocol.pdf Cas9_MTA
多基因编辑 LbCas12a DNA TTTV >70% 随机的小片段插入/缺失；基因失活 非TTTV位点无法编辑，且编辑效率受温度影响 已构建9个基因的敲除载体，9个基因都有编辑，最低编辑效率在70%左右
大片段删除 LbCas12a-BeYDV DNA TTTV <17% 设计两个及以上靶标，删除靶标之间的序列片段 需要至少两个靶标同时编辑才可能删除中间片段 设计两个靶标，精准删除了靶标之间的1.07kb，效率约为17%（12个材料中检测到2个有删除）